Mineralogicko-petrografické oddělení MZM je partnerem projektu Partnerská síť pro spolupráci a aplikace v geoenvironmentálních a geotechnických oborech (CZ.1.07/2.4.00/31.0019) podpořeného z prostředků ESF a OP vzdělávání pro konkurenceschopnost.
Etnografický ústav MZM je partnerem projektu Rozvoj spolupráce a zvyšování výzkumných kompetencí v síti etnologických institucí (CZ.1.07/2.4.00/17.0038) podpořeného z prostředků ESF OP Vzdělávání pro konkurenceschopnost.
Moravské zemské muzeum je partnerem Vysoké školy obchodní a hotelové v rámci projektu ESF Inovace studijního programu (CZ.1.07/2.2.00/15.0440)